2005年2月18日，英国在肯德基食品中发现苏丹红，下架食品达500多种。
2005年2月23日，中国国家质检总局发出紧急通知，重点检控进口产品中的苏丹红一号，以防进入国内流通渠道。肯德基所属百胜餐饮集团立即要求供应商对相关调料进行检测，并提供书面确认。
2005年2月25日，百胜供应商广东中山基快富食品公司发来书面回复确认其供应的产品不含苏丹红。
2005年3月4日，北京市有关部门从亨氏辣椒酱中检出“苏丹红一号”，并确认苏丹红来自广州田洋。百胜再次要求所有供应商继续排查“苏丹红一号”，并把重点转向国内原料。
2005年3月15日，在肯德基新奥尔良烤翅和新奥尔良烤鸡腿堡调料中发现了微量苏丹红（一号）成份。
2005年3月16日，百胜要求全国所有肯德基餐厅停止售卖新奥尔良烤翅和新奥尔良鸡腿堡两种产品。同时启动内部流程妥善处理并销毁所有剩余调料，防止问题调料回流到消费渠道。通过媒体和餐厅发布中国肯德基“有关苏丹红（一号）问题的声明”，向公众致歉。
2005年3月17日，百胜品控人员在基快富工厂进一步追查苏丹红时，在生产记录中发现宏芳香料（昆山）有限公司提供的含苏丹红的辣粉也曾经在2005年1月12日以前用在部分肯德基香辣鸡翅、香辣鸡腿汉堡和劲爆鸡米花的调料中。肯德基立即通知所有餐厅停用少量剩余基快富调料，由味好美的同样调料替代。
2005年3月17日，在百胜集团对上述3项产品调料掉换处理前，北京市进出口检验检疫局在此公司的万惠餐厅抽样了该批有问题的调料。
2005年3月18日，北京检验报告证实该基快富调料含有苏丹红。虽然公司已通过专业测试保证来自味好美的新调料不含苏丹红，但北京市食品安全协调办公室为了确保市民安全，要求公司将新调料送交该局再次 检测，并且在该局证明不含苏丹红之前，必须立即停止销售3项产品。为了配合北京市食品安全协调办公室的指示，北京肯德基不得已暂停3种产品销售。
2005年3月22日，新调料经过北京市食品安全办公室确认不含苏丹红，随即北京恢复了香辣鸡翅、香辣鸡腿汉堡、劲爆鸡米花三种产品的销售。
2005年3月23日，通过国家认证检验机构测试不含苏丹红的新奥尔良调料准备就绪，该产品三天内在全国陆续恢复销售。
2005年3月28日，肯德基在全国16各城市，同时召开新闻发布会，宣布经专业机构对肯德基几百种相关品项检测，证实所有产品不含苏丹红。公司查明所有问题均来自中山基快富公司的供应商宏芳香料（昆山）有限 公司。宏芳曾向基快富提供两批含苏丹红的辣椒粉。这两批辣椒粉中的一部分用在了肯德基的新奥尔良和香辣产品中。会上，肯德基宣布了三项食品安全措施，全力防范今后类似事件的发生。
2012年10月19日，湖南长沙市第三季度食品安全检验检测情况报告公布，长沙肯德基有限公司阿波罗分店的香辣鸡腿堡出不合格名单中。长沙市卫生局抽检了8月29日批次的肯德基香辣鸡腿堡，发现大肠菌群含量为230MPN/100g，按照食安糕30MPN/100g的标准，此汉堡超标近8倍。
肯德基方面的食品安全部门对此提出异议，认为汉堡不是面包，不能以面包糕点的标准来衡量，要求卫生局重新考量。长沙市卫生局将此事汇报至湖南省卫生厅，并咨询了湖南省疾控中心的相关专家之后，临时将肯德基汉堡从不合格名单中撤销。相关负责人表示，对于洋快餐汉堡的安全性无法判定，因为国家还没有技术层面的检测标准。
2012年12月被爆出“速生鸡”事件，其主要供应商为三和集团，此次事件对其销售有较大的影响。
“药鸡”事件风波尚未平息，又有消息称，中国河南大用集团长期加工病鸡、死鸡，销售给麦当劳、肯德基、德克士等洋快餐。对此，河南大用集团声明坚决否认。肯德基声明称，若发现有违规行为必从严处理。德克士则称，食品原料均选用检疫合格的活鸡。
病死鸡被曝流入洋快餐
中国网河南频道报道称，大用集团的白羽鸡由于生长环境恶劣，大批量的鸡在长成之前就因为某些疾病被紧急出棚屠宰，进而流入市场。报道引用知情人士的话称：“死鸡并没有就地无害化处理，而是被拉到了几十公里外加工成鸡粉、鸡骨粉。”
根据河南大用集团官网介绍，凭借过硬的质量和品牌优势，大用集团成为肯德基、麦当劳、德克士等著名快餐连锁企业的重要供货商。
快餐企业 若有违规从严处理
隶属于百胜的肯德基在其官方微博上发布声明表示：“百胜高度重视媒体报道的相关内容，将密切关注事态进展。如发现大用集团有任何违规行为，一定从严处理。”
“十一种神秘香料”融入鲜嫩鸡肉中，外脆里嫩，鲜美多汁。
以上是肯德基“上校鸡块”的外包装上所标注的字样。看到这些诱人的宣传用语，大部分消费者或许会不由自主地咽下几滴口水。不过，有消费者在受此诱惑并痛快地品尝一顿之后，却又心生疑问。
《市场导报》记者分别接到浙江和广东的消费者投诉，称“十一种神秘香料”的宣传涉嫌欺诈。温州的一位叶先生2012年11月8日，与朋友前往肯德基温州安泰分店用餐。当时他就留意到了“上校鸡块”包装盒上的“十一种神秘香料”的标注宣传。用餐之后，他特意问了下餐厅工作人员，这“十一种神秘香料”都是什么物质，但工作人员以“商业机密”为由拒绝答复。
对于多方面的质疑之声，肯德基公司如何看待。《市场导报》记者日前通过多种渠道与企业进行了联系，但始终没有得到企业的回应。
据媒体报道称，英国超过六成的餐饮连锁店提供的冰块细菌总量，甚至超过取自马桶水箱的水。当日，某电台记者从肯德基崇文门店买来可食用冰块，同时抽取马桶水样品后，送往检测中心进行对比检测。检测结果显示，肯德基食用冰块菌落总数高达2000个每毫升，高于国家标准19倍，高于马桶水12倍。
一家网站联合国内第三方检测机构—华测检测对市面上永和大王、麦当劳、7-11、肯德基四家的豆浆进行检测，发现肯德基的豆浆中含有转基因成分。
2014年2月20日，中国农业大学食品科学与营养工程学院副教授朱毅向《第一财经日报》表示，加工原料中如果采用了转基因原料要明确标识。另有食品专家向记者表示，转基因大豆主要源自进口大豆，而进口大豆只用于压榨豆油以及饲料，严格来说不能上餐桌，肯德基如果真的使用了转基因大豆上餐桌，或将违反国家相关法律。
根据上述检测报告，被检测的四家企业的豆浆仅有肯德基豆浆检测出转基因成分；检测报告的检测方法采用NY/T 675-2003。检测的三个项目CaMV35S、Cp4-EPSPS、NOS均未检出（检测限度0.1%），因此，推测肯德基豆浆是由转基因大豆制成的。
肯德基方面回应称，已展开核实工作，肯德基豆浆粉供应商书面重申他们使用的是非转基因大豆，均来自中国东北产区。肯德基欢迎社会各界监督，但对该网站的采样过程、检测机构检测转基因的资质、检测报告及发布渠道等存疑。
为了审慎起见，肯德基已将视频内容及相关情况向有关部门备案。
国际公认转基因大豆不存在安全问题，也就是说转基因豆浆不存在安全问题，但如果采用了转基因大豆必须有标志。也有专家表示，国家在国能否使用转基因大豆做豆浆的规定中有些模糊，但严格说来，转基因大豆不能上餐桌，因此，转基因豆浆在国或违规。
2014年7月20日，据上海电视台报道，作为麦当劳、肯德基等公司的供应商上海福喜食品有限公司，将过期8个月的、颜色发青的臭肉重新切片装进新包装，将“保质期”延长了1年。每天会有专人制作两套报表，以掩盖真实的生产日期。 [12]
2015年3月17日，英国广播公司（BBC）播放一部纪录影片将肯德基供应商养鸡场的内景首次展示在公众面前：3.4万只鸡挤在几乎没有窗户的养殖棚内，被圈在同一个养殖棚里的鸡几乎生活在自己的排泄物中，粪便随处可见。棚内到处堆积着锯末（供应商称那些锯末是用来保持养殖棚干燥用的），像是一个个从没清理过的垃圾堆，鸡仅仅存活35天后，就被毒气“放倒”，之后进行屠宰分割。
动物救助组织成员安德鲁·泰勒指责，这些动物被剥夺了作为生命的一切，在没有窗户的臭气熏天的棚子里忍受压抑的存在。很多鸡因为脱水等原因而死亡，英国每年大概生产9亿只小鸡，其中3000万只死在养殖棚里。
肯德基公司的发言人回应：肯德基的所有供应商对动物的福利都超过了英国或欧盟对动物福利的所有要求，肯德基获得了英国红拖拉机（Red Tractor）食品安全体系认证，同时拥有更严格的标准，并由第三方独立审查 [13]
2015年6月，KFC一纸诉状将山西微路况科技有限公司、太原零点科技有限公司和深圳市赢陈安之成功文化传播有限公司告上法庭，指控其通过微信散布6个翅膀和8条腿的转基因鸡制作和销售食物谣言。KFC向每家公司索赔24.2万美金实际损失费。
2016年2月，上海市徐汇区人民法院对这起案件做出判决，三家公司侵犯KFC名誉，致其造成经济损失。三家公司须向KFC共支付9.12万美元的罚款并为散布谣言向其致歉。 [14]
2021年4月10日，据江苏荔枝新闻报道，2021年3月29日下午，来苏州打工的女子小杜和朋友小陈到苏州吴江汽车客运站坐车，距离发车还有一段时间，两人来到车站里的肯德基餐厅吃饭。吃完一支冰淇淋后，小杜觉得口渴，于是向服务员要了一杯冰水。小杜喝了一大口嘴里反出来一股消毒水的味道，但杯子里的水闻起来又没有刺鼻气味；于是她又喝了第二口，这回连嗓子都有一阵灼烧感了，小杜这才意识到自己喝下去的可能是消毒水。在接到小杜和小陈的反映之后，肯德基的服务员也尝了口杯子里的水，也立马吐了出来。由于担心喝下去的水会影响身体健康，在离开这家肯德基餐厅时，小杜主动找到了店长，对方承诺会对此负责。当天下午4点多，小杜坐车回来后，嗓子和胃部就出现严重不适，她赶紧到附近的医院就诊。经过检查，医生诊断小杜患有因误食消毒水导致的急性糜烂性胃炎和胃痉挛。此后肯德基餐厅承担了小杜1500多元的治疗费用，但小杜提出，自己的身体还没有完全康复，无法正常上班，肯德基还应该承担相应的误工费和营养费。但肯德基只愿意再给1000元的赔偿，还要求小杜要先签署一份保密协议，肯德基苏州吴江客运站店工作人员在电话中说：“给到钱以后，后续你不可以到网络上发布相关的什么。” [15]
2022年1月12日，中消协发文称，肯德基与盲盒销售商泡泡玛特联合推出的“DIMOO联名款盲盒套餐”，引发消费者抢购及社会广泛关注。有消费者不惜一次性斥资10494元购买106份套餐；还有消费者为“求娃”而购买“代吃”服务，雇人代买代吃套餐而获得盲盒，甚至不排除将吃不完的食物直接丢弃。中消协认为，肯德基作为食品经营者，利用限量款盲盒销售手段，诱导并纵容消费者不理性超量购买食品套餐，有悖公序良俗和法律精神。 [19]
盲盒套餐，是盲盒营销的产物。盲盒营销是否得当，尚可探讨。但，不是万物皆可“盲盒+”作为餐饮企业，特别是快餐经营，理应知道食品保质期的重要性，也更懂得限时做、限时卖与限时消费的重要性。如此制造营销噱头，刺激消费冲动，引致严重浪费，有悖于社会公德，也违背了知名企业应尽的社会责任。被点名批评、备受诟病，说明盲盒一旦侵入餐饮领域，很容易人为制造“舌尖上的浪费”，只会是一场错误失败的、哗众取宠的营销。（人民网评） [20]
2022年3月8日，国际快餐品牌肯德基的母公司百胜集团将暂停在俄罗斯的肯德基餐厅的运营，并协商暂停在俄必胜客餐厅的运营，同时中止在俄罗斯的所有投资和餐厅发展业务。 [22]
2023年4月17日，据彭博，百胜餐饮集团表示，它将其在俄罗斯的肯德基业务出售给了Smart Service，从而完成了从俄罗斯的退出。 [27]
2024年8月23日早间，在社交平台上，有网友反映肯德基App“崩了”，点餐显示“系统迷路”“前方拥挤”等问题。
2024年8月23日上午肯德基官方客服表示，没有接到App出现问题的通知，如果是点餐时候显示“系统拥挤”有可能是短时间内点餐人数太多导致。客服表示，“目前肯德基和《恋与深空》联名套餐在售，但由于需要预约，而且限量，可能出现预约点餐页面显示没货，但一些用户依然不停刷新页面的情况，会导致系统卡顿、延迟。” [40]
天津市多个肯德基使用转基因大豆油
2024年10月，天津市多个市场监管分局发现辖区内“肯德基”使用的都是该品牌的转基因大豆油，且都没有向消费者明示。多区市场执法人员也分别对这一涉嫌违法行为进行了立案调查。
对此，凤凰网财经致电天津肯德基曹庄餐厅等门店，多家天津肯德基门店未有人接听电话。一位天津肯德基和平印象城店员工告诉凤凰网财经：“食品没有问题，门店正常营业。”当听到询问“该门店没有查处是吗”，对方直接挂断了电话。对于其他肯德基门店是否也使用转基因大豆油的问题，凤凰网财经致电某北京肯德基门店，接听电话的工作人员表示：“各个门店不一样，我们不清楚这个问题。至于天津多少家门店被查了，我们也不清楚，我们也没有关注。今天公司也没给我们通知，我们店每天都有领导审查，我们店没有问题。”
