2015年，百果园荣获“年度果蔬零售商 ^[61]”称号。 ^[60]同年，获得中国连锁经营协会颁发“中国优秀特许品牌”殊荣 。

2016 -2018年，百果园连续第三年获“CCFA员工最喜爱公司”称号。

2018年，百果园获评“2018全国果业精准扶贫功勋企业”。

2019年，百果园荣获中国优秀特许品牌奖。

2020年6月，中国连锁经营协会(CCFA)发布了“2019年中国连锁百强”榜单，百果园再度上榜，成为唯一一家连续5年入选连锁百强的水果连锁企业。

2020年7月22日，获评艾媒金榜(iiMedia Ranking)发布的《2020中国新经济独角兽本地生活领域TOP20榜单》前20名。

2020年，百果园获深圳市扶贫办“消费扶贫爱心单位”称号。

2021年，百果园获农业产业化国家重点龙头企业。

2022年，百果园入选“2022年中全球独角兽榜” ，并获得SGS食品安全管理体ISO22000:2018 认证 。

2023年，百果园成功入选中国质量报刊社·中国质量新闻网“2022年度质量金盾案例”。

2024年，百果园获福布斯中国2024大消费年度影响力连锁品牌”。

2024年5月，百果园获“环球品牌可持续发展典型案例”荣誉称号。