李玟的父母都毕业于北京大学，其母亲是武汉人，出生于重庆，后为躲避战火随家人辗转四川各地，抗战结束后，李母跟着家人一起离开四川来到武汉，此后前往上海学医 ；父亲李碧延是哈尔滨人，也是印尼华侨。在李玟母亲怀孕期间，李玟父亲因病过世。李玟有两位姐姐，分别是大姐李秋林与二姐李思林 。
2010年10月2日，李玟在“东西”巡回演唱会新加坡站中，对外公布了与香港利丰集团执行总裁乐裕民的婚讯。
2011年10月27日，在香港丽思卡尔顿酒店举行婚宴。10月28日，在将军澳邵氏片场举行媒体见面与答谢宴 。
李玟在出生时被医生从脚被拉离母亲肚子导致脱臼，两岁开刀后失败，状况没有好转。2019年6月，她的骨盆形状已经磨损，在医生的建议下决定手术治疗，但因演出排期满档，手术计划被推迟 。2022年10月初，她的髋关节移位，在没有软骨的保护下，神经线被压住，导致无法正常生活，她因此接受手术治疗 ；该腿部手术于2023年3月完成。
2007年，李玟的嗓子开始出现无法发声的状况，不只中高音唱不出来，就连平时说话都辛苦。数月后，在欧美声乐老师的帮助下，重新调整发音方式。
2016年2月，李玟透露因患上急性支气管炎而完全失声，喉咙出现严重状况。
2023年8月15日，李玟老公Bruce发布声明，声明中提到，李玟在2022年确诊乳腺癌，但她坚持录完《中国好声音》再就医。
2023年7月5日晚，李玟的姐姐李思林发布微博称，李玟于数年前不幸患上了抑郁症，经过长时间与病魔斗争，可惜近日病情急转直下，于2023年7月2日在家中轻生，送院后一直昏迷，经医院团队努力抢救及治疗，最终于2023年7月5日返魂乏术，与世长辞，年仅48岁。
2023年7月14日，李玟姐姐李思林发文称，李玟丧礼及出殡仪式于7月31日及8月1日举行。
8月1日，李玟的遗体正式火化 ，而出殡仪式则于当天在香港举行；
10月15日，李思林受访透露，计划月底安葬李玟的骨灰 ；10月，李玟确定在武汉石门峰纪念公园安葬；
10月21日，李玟在武汉石门峰纪念公园下葬 ；当天，李玟家人的律师称，李玟死因调查可能长达数年，尸检已完成，证据已固定，安葬不会影响死因调查 。
2024年6月15日，李玟出道30周年的日子，李玟铜像揭幕仪式将在李玟长眠的武汉墓园举行，届时，也将发布她生前与两位姐姐翻唱的《When Will I See You Again》的中文版《珍惜今天》，此曲是继1997年《我的翅膀》后，三姐妹再次合唱的歌曲。
