娃哈哈创业30年来都不上市，不仅不上市，还一直不融资。宗庆后说： “上市就要给股东负责任。如果最后股票跌了，让老百姓损失大笔钱，我觉得也不合适。”宗庆后有不上市的底气。娃哈哈在银行存了上百亿，足够多的现金流，是他应对市场风险的办法。这种不被人看好的“笨办法”，却像一根定海神针，穿越了经济周期，稳住了企业底盘。
1996年，娃哈哈与法国达能达成合资协议，百富勤公司和达能共同出资4306.95万美元，取得了娃哈哈51%的股份。随后百富勤将持有的股权卖于达能，达能成为娃哈哈控股51%的大股东。2007年4月，达能欲强行以40亿元人民币的低价，并购杭州娃哈哈集团有限公司总资产达56亿元、2006年利润达10.4亿元的其他非合资公司51%的股权。宗庆后予以坚决的反对。在双方矛盾无法调和时，双方的诉讼也全面展开。达能在中国、美国、欧洲等地都起诉了宗庆后等人和娃哈哈公司。2009年，达能把其在合资公司中拥有的51%股份，以30亿元人民币的价格卖于娃哈哈，娃哈哈达能之争落下帷幕，宗庆后顺利夺回娃哈哈的绝对控制权。
2019年3月，娃哈哈旗下产品AD钙奶包装瓶上印有两名佩戴红领巾的小女孩在玩“翻花绳”游戏，瓶身印有“高中的时候，班里不知道是谁说喝AD钙奶可以从A变到D，然后就掀起了一阵风，班里女生都开始喝AD钙奶。”对于上述现象，有网友认为AD钙奶为儿童饮品，上述标语略显低俗，且有暗示饮品丰胸的嫌疑。杭州市上城区市场监督管理局工作人员表示：针对娃哈哈AD钙奶瓶身宣传标语引发质疑一事，将介入调查。
2019年3月5日，针对娃哈哈旗下产品“AD钙奶”被质疑低俗营销一事，娃哈哈官方回应：AD钙奶留言瓶的每条内容都选自网友真实留言并获得授权，并非广告语，印制留言瓶的初衷，是为了分享与AD钙奶有关的美好记忆。在接到关于部分瓶身留言的质疑后，娃哈哈第一时间对所有留言进行了更加严格的审核，对于引起歧义的内容已经停止印刷生产，并向消费者致歉。
2018年，宗馥莉上任娃哈哈公关部部长，随即更换娃哈哈纯净水20年代言人王力宏。
2023年6月，诸暨市人民法院在阿里资产平台拍卖1.675万股娃哈哈实业的股份，起拍价7.5万元，17人报名参拍，经历124轮竞拍，最终以34.2万元成交，溢价率356%，最终成交价格折合每股20.42元；12月19日，娃哈哈实业5万股股份完成拍卖，起拍价85万元，经历48轮竞拍，最终成交价110万元，折合每股22元。该次交易的卖方是杭州文化产权交易所有限公司，阿里资产平台将该笔资产定性为优质股权；12月24日，娃哈哈实业股份4.1万股股份被拍卖，起拍价69.7万元，卖方为杭州文化产权交易所有限公司。本次交易历经44轮竞拍，最终成交价格129.2万元，每股成交价格约31.5元；12月28日，卖方为杭州文化产权交易所有限公司，标的为娃哈哈实业3.9万股股份，起拍价70万元，最终成交价87万元，折合每股22.31元；12月29日，“娃哈哈”10万股股份被竞价转让。起始价184万元，保证金为人民币36.8万元，增价幅度5000元，此次股份竞价转让方为浙江省饲料有限公司。
2023年10月，浙江省人民政府公布的行政处罚信息显示：杭州娃哈哈集团有限公司因广告违法行为，被杭州市上城区市场监督管理局罚款5万元。处罚事由显示：当事人在娃哈哈官方网站栏目页面中介绍“线下渠道”时展示了一张图片，该图片类似中国地图的地形图。经杭州市规划和自然资源局协助调查涉案地图中的相关情况，鉴定结果为“该中国示意性地图漏绘南海诸岛，违反《地图管理条例》第八条及第二十四条的有关规定”。
2024年1月，一张缅北品牌的“佤哈哈”瓶装水照片在网络上流传，这款标识为“佤哈哈”商标的瓶装水外包装与中国“娃哈哈”纯净水雷同。1月6日，缅北佤邦的品牌厂家相关负责人回应称：“情况属实，商标‘哈哈’二字侵权，随后就改了名称。
佤哈哈
2024年2月，网传说法：“娃哈哈水一直用纸箱包装，而不是用塑料纸包装一提。员工说宗老不让，因为这样会断了基层靠捡纸箱维持生计的人收入来源。”娃哈哈回应称：饮用水包装是根据数量的多少有区分，12瓶装的纯净水是裹膜包装，24瓶装的是纸箱包装，产品品质都一样，只是规格不同。有人认为：这是蹭娃哈哈流量编故事的做法；还有人表示：宗庆后是值得尊敬的企业家，但不应被“捧杀”。
2021年9月，娃哈哈正式开启“实验室用水支持计划”，专项赞助中国部分高校以及各大研究机构实验室，免费提供一年份纯净水实验用水。
2024年2月，“娃哈哈实验室御用水”的话题冲上热搜榜第一。从化学、生物到食品、材料领域，娃哈哈纯净水频频出现在实验材料清单、实验报告、毕业论文里，几乎已经成为实验室里用量最大的耗材。 3月18日，娃哈哈2024实验室用水支持计划正式启动，计划送出596吨娃哈哈纯净水，专项赞助中国研究机构、医疗机构、高校等实验室以及需要高标准纯净水的组织和单位。活动对象还包括在日常工作环境中需要高标准纯净水的组织或单位，涵盖食品生产、制药、医疗、保健、环境检测、生物科技、母婴护理等领域。
2024年2月起，有自媒体发文称：与娃哈哈同处杭州的农夫山泉与其有“宿怨”，以及“农夫山泉创始人钟睒睒第一笔创业收入来自娃哈哈”“因冲货被开除”等。
2024年3月3日晚，农夫山泉高层密集回应，称传言不实。农夫山泉股份有限公司董事长钟睒睒发文《钟睒睒：我与宗老二三事》，缅怀、悼念娃哈哈集团创始人、董事长宗庆后，并回应相关网络传言。钟睒睒表示，宗庆后一直是他尊敬的企业家。宗庆后与他亦师亦友，也互为竞争对手。前些时日得知宗庆后病重，他立即托人请求探望，但彼时宗庆后已不便见客，遗憾未能成行。宗庆后逝世后，他前往灵堂叩拜吊唁、敬献花圈，并对宗庆后的家人表示慰问。
2024年3月4日，娃哈哈集团公关部回应：“我们对此没有（回应），因为本身网上的评论，我们并没有参与。”
2024年3月，一封署名为“杭州娃哈哈集团有限公司”、落款时间为3月3日的信在网上流传。这封“致全体销售人员的一封信”中称，现在是娃哈哈受到空前关注的时刻，所有人的支持我们都感受到了，但同时也有很多声音在说断货。信中表示，公司已出台了最大力度的保证金奖励政策，开展了促销活动，并动员全公司力量组建了终端铺货突击项目组，目标是“让所有人看得到、买得到娃哈哈产品”。
2024年3月，海容冷链表示公司收到了娃哈哈的冷藏展示柜订单。 [86]网传视频显示，娃哈哈正在加大线下冰柜的投放力度。
2024年2月，娃哈哈集团创始人宗庆后因病逝世。2月28日、29日娃哈哈官方旗舰店并未开启直播，但销量涨超500%，销量排名第一的商品为娃哈哈AD钙奶。娃哈哈官方发布公告：近期得到大家无数的关心与支持，店铺订单量明显增加，公司安排了更多同事打包发货，请大家耐心等待，等不及的家人可申请退款退货。没能让大家有更好的服务体验，娃哈哈深表歉意，也建议大家理性消费，按需购买。 3月，部分电商平台的娃哈哈系列产品都已售罄，部分店铺改为预售，最晚约1个月后发货。
2024年3月，娃哈哈产品持续热销，网友喊话娃哈哈推出啤酒产品，认为啤酒更适合跟随品牌一起长大的这代人。甚至制作了产品宣传片。针对娃哈哈的啤酒应该如何称呼，网友还争论了一番，有网友说应该叫“哈啤”，有网友却认为应该叫“娃啤”。娃哈哈直播间也就此事进行回应，称已经把啤酒需求反馈给了研究院，而生产新品需要一定的时间，希望大家耐心等待。同时呼吁，由于直播间有很多未成年人，酒类可以优先去其他平台购买。
“娃哈哈咖啡”是以娃哈哈旗下产品为原材料调制的特色咖啡。为响应消费者需求，多地陆续有咖啡店推出“娃哈哈咖啡”系列产品。
2024年4月，有网友反映称，未开封的娃哈哈营养快线饮料中出现“像蟑螂”的异物，消息引发广泛关注。对此，4月2日，娃哈哈方面回应南都记者称，该消费者反映的情况实际由运输装卸环节撞击产生瓶口松动，漏气后致使内容物变质结块造成，非产品本身质量问题。有关“蟑螂”的表述与实际情况不符。
2024年9月6日，多位娃哈哈集团前员工和内部职员称，因为娃哈哈集团近期要求员工重新签署劳动合同、以较低价格回收员工持股会股权，已有几十名员工发起集体诉讼维权并已进入司法程序，坐等法院正式受理。
娃哈哈声明
2024年9月7日，娃哈哈在微博就此前“要求员工重新签署劳动合同”等报道发布声明称，工会从未听说“娃哈哈维权委员会”的相关信息，目前工会也未收到所谓“娃哈哈维权委员会”提起的诉讼信息；据工会了解，杭州娃哈哈集团有限公司职工持股会内部股份回购事宜经过会员代表大会全体决议通过，相关协议由持股会会员自愿签署，合法有效，不存在损害持股会会员的情形；针对萧山顺发股权转让问题，据工会了解，是萧山顺发正常股东变更股权转让合法有效，符合相关法律法规，并经工商部门审核确认，并无外界揣测特殊原因。娃哈哈表示，工会的管理及工作秩序一切正常。
2024年9月8日，一位娃哈哈前员工告诉蓝鲸新闻记者，“此次维权人数大概有五六百人，目前诉状已递交杭州市上城区人民法院。”据蓝鲸新闻记者了解，此次争议主要涉及劳动合同改签、股权回购、利益分配等事宜。 [112]
2024年9月，有超过50名娃哈哈员工提起诉讼，将和宗馥莉和公司第三大股东娃哈哈职工持股会告上法庭，目前法院已经正式受理娃哈哈员工的诉讼材料。
针对娃哈哈集团员工的集体维权举措，娃哈哈集团相关负责人对中国网财经记者表示，娃哈哈是一家负责任的公司，始终坚持维护公司员工的合法权益。对于网传的员工劳动合同关系、股权回购等事项，公司前期的处理具有事实和法律依据。
